CDS

Accession Number TCMCG020C06329
gbkey CDS
Protein Id RAL40259.1
Location complement(join(60978..61185,61290..61380,61778..62204,62780..63130,64001..64159,64273..64476,64641..64844,66614..66826,66948..70280,70390..70541,70643..71138,71647..72388,72456..73567))
Organism Cuscuta australis
locus_tag DM860_006329

Protein

Length 2563aa
Molecule type protein
Topology linear
Data_file_division PLN
dblink BioProject:PRJNA394036, BioSample:SAMN07347267
db_source NQVE01000194.1
Definition hypothetical protein DM860_006329 [Cuscuta australis]
Locus_tag DM860_006329

EGGNOG-MAPPER Annotation

COG_category S
Description Ribosome 60S biogenesis N-terminal
KEGG_TC -
KEGG_Module -
KEGG_Reaction -
KEGG_rclass -
BRITE ko00000        [VIEW IN KEGG]
ko01000        [VIEW IN KEGG]
ko03009        [VIEW IN KEGG]
KEGG_ko ko:K07766        [VIEW IN KEGG]
ko:K14861        [VIEW IN KEGG]
EC 3.6.1.52        [VIEW IN KEGG]        [VIEW IN INGREDIENT]
KEGG_Pathway -
GOs -

Sequence

CDS:  
ATGGAAGATGCCGATAACAAGAACTGCGGCGGGGTATCGGTCTCCCACAATTTCGAGGGAAAGGTTTCCATGGAAGCTAAGCTTAAGCAGCTCCTCCGAAACATAACCTCCGTGGAAAATCAGCTTTGTTTTGAAGCTTCAAAGGAGTTCATCAAGTTGCTAAAGTCTGAATCTGGTTCGGAATTGATTCGTTTGTACCTTGAAAACTCTCCTAAATGTATTGAGCTCTCGCAGACCTGGGACTCTCAGAAAGGCAATCCTGGATTTTCGTATGTACTCAATCTGATTGCAGCTGTTCTTAGCCACCCTTTCGGAAGATCCGAAAACAATATGCAGTTGTTGGATAAGTTTGCGCGTTGGGTTGTGGATGAGAAAATGGATGATTTGTACAAGGAGTTGAACAGTAAAGATGTGAAGAGCCAGAATTCGACATTGTCTTTGTTATCTGCAATTGTGAGGCGTGGTTCGTGGTTAGCCGGGAAGGTGGCAAAAGTATTCGATTTTAATCTTCCACTTTTTCGGAAGCCAGCCAAGTGGAAACCAAGGAAAGGTGATGTGAACAGGAAACATCCTTCAACTAGGAAGGCTTTTGTAGAGTTTGCCATGTCTTTCTTGGAAGTGGGCAATGCCAGGTTATTGAGGGAAGTGTTGCAACAGAAGGATTTGTATTTGGGGGTGCTTCGCGGGCTAGGAAAAGATGAAGACGATACAGTGATTCTTGTGCTATCAGTTTTGCGTGATCGTGTTCTGGTTCCCGAGTCATTGGTGCCCCCTGGACTTAGGAGTGTACTTTTTGGTACTGTGACTTTGGAGCAACTGGTTAACATTTCTGGTAGAGATGATGGAGGGGAAGCTGTGGAGCTAGCTCATAGTGTCTTGCTAATGGTTTGTACAGACCCTTTGAATGGGTTGATTCCAGATCTGGAGAGGATTCCTAGTCCTTTAAGAGGCAATCCAAGACGACTATTGGATGTCATGAAGAAGCTGAGAGCTACAGAAACAGAGTACCACAGAAACCTTCTACTGGCCATTGTAAAAGCAAAGCCATCTTTAGGCTCAGCATACTTGGATGCATTCCCTTATAACACTGAAGATCCTGCATCACCTAACTGGTTTGGTACCACTTTGTTGGCTGCAGATCTCATTTTCTCTGTCCATGATGGCTATTCTTTTGGTTTTATTGATATTATGAAGCAAGAACCAAAAAGTATTGAGTGTCCAGAACTCCGAAGTATTCTAAAATGCATTTGCCCGTGTCCATTTACTCGTCTGATTATCAACAAAGGCTTGCTTCATTCCGATACCCTCGTGAAACATGGAACTTTGAAGCTTGTATTGGAGTCACTTAGGTTTTTTGACTCTCTAATTGATGCAGTAAACTGCATACCCTCTTCTGATATCCAAATGGCACCTATATGTTCATCTCTCAAGCTAGATATAGTGAATGAAGTCAGGATTTTGCTTCCTGACCCCCAAGTTTTGTTCTCATTATTGTCTTCACTTAATGACTACCATAGAATCATGGAATCACATGGGAAAAGAGCAGCAGATTCAGAAATTCCAATTGAAGACAATACAAGTAGCAGGAAAAAGTTGAAAATTGATAAAAGTTTGAAAGAAGATATTGATATTATAGTCGGCGGGATTAGTTCTTTCCTTTCTGATACAGATATGCAAGGTTATGGTGAAGGAATCCTTGATGATGATGATTCAGTTCAATGTAAAAATGAATCCCAAAATTTAAAGCTTATAAGAGAACTTTGGTCTGAGAACTCGTGTTCTTGTAAGGACACAGTTGAAGATGCAGAAACAATCTTCTACACAAAGTTGCTTGATGTTCTGAAACTATACTATCGCACTATGCCCAATATGATGGAAGGGTCGTTTGATTTCTTCAAACTTCTTCCGAGCAATCCTTTGGCATTGCCCATTATTTTGCAGCATTCTTTGTTATCTTTGTTAACTGAGGATATTGGTTGGTCCTCCACATCTGAGACCGCCTCCAGAGCTCAAACACAGTTCTACAAGCATCTACTTCCACTTCTAAATTTATTAATTTATTCACCAGAGAGAAGCATCAAGGATCACGCATACGCTCTGGCAAAGGCAGCCATGTTAAGTACAGGTGCATTTGATAACAACCCAAGGGAAGTATGTGCATGGTTCATGTTTATTCCCGGATACGGTGAAGGCTATGCTCTCGCTGGAGACTTGAAGCTAGAAATATTCAGAAAATTGTCCTCTGGTGTTCTTTCCTTCCTTTGTGATGCAGTCTCAACAGTTGGTAATAATATGTTTAAATATATGGATCTCTTGAGGTCTTATATCCACAAATCAGAAGACGGTAAAGATGTATCAGCTACATTCAGCTGCTTCAGTATCTGTATCATGGAGAAGTGCCTAAGGATACTATGTTCTAAACCAAGTTCCTTTTCTTTGTCTGAGAAGTCAATGATTTCCTTCTATGTTTGCAATGCATTTAAGTATATCATGCAAACTCAGGTTGATCCAAGATTGTTGGCTTCCCTCACAGGTCGTTTGCTTTCTGAAAGACTCACAGAATCTTACGACATTGCTGCTGACTCCAACAGTTTCTGTGAGTGGACGCCATTGAAGAAATTATTCCAATTTTTGAGGGGCATATTACAAGGTCTAACTTGCAATAGCTTTTCCAGCATTGTGGAGATTGGGCATCATGATAGTGCTTTCAAAAGTATACTCCGTGAAGTTAGAAGTGTTTGTGAGATGGAGTCTGATGGGAGATTGGTTGCGACAGGGATTGGATTTTCCTTTTCGATGATATGCACTCAGCAGGCTGATTTACTAAAAAATTTCCCACTAACTATATCATTATCGAATAAAATGCTCGAGGTACCTTTCTCAATCTTGATGTTGATATTCTTCCTTGAACCTAATCTTCTCGTCAATGTGTCTAAACTATGGCCAGAAATGTTCCTTACTGGTCTGGAAGGTGCTATTGCTGGATTACAAAGACACGAAGAACCAGAAGAATTTGGCAACATTGATTCAATGGAGTTTGCATCTGCTTCATTCTCCCTGTTCTTGAAGCATGCACCATTCTATATGCTCTTTCCTTTTATTCCAAGCATTTATAGGTTTGATTTGTCCGCTCAGGGGGGTTTGCAAAATCTTATTCTGGCTACTCTTTCTGAGAGGACACCAGATTATATTATATCCTCATTTCTATATGTGCTACTTTGGTTGAATGAAGCACACAGATCCTATCGAATTGAGCCACAGGATGAATTAGAAAAGCTTTCTGAATGGTGCTTTTCCATTATGGATCACATGCTGAGACGATTAGTTAACACTAAAGTTGATTCAAGCTTGAAATGCACCAGGTCTATTTTAGAACTAGTTCCAACGATCATTTCTCACCCCACTGTTACAGCTGCACTGGAGTGCCCTATACCAAGTAATGCTGTTCTTACAGATATTTATATTGGGGACAGTATGGACAAATTTGTTGAATCAAATAAGTGGAAGGTGATTCACAAAATGGATCTACATGCCATAAACTTTTTAAGAACGACATCTGAGCTCTTCATGTATTTTTGCTGTGGGCAAAGGTCTTCATTTGTAGCTTTTCATGCTAGACATGTCACACATTCTTTCAAAAATATGGTGCAAAAATTATTTTTGACATTCAGGGATTCAATTAATAAATGTATAGAAGATAAGGATTTGGCCGTGCTTTTTCCAAAGGTCTATGCGTTACACTCTTTGAGGCAATTCATCTCTCCCTTTGACCTGCTTGAATGTGTGAATTGGATGCTCTCTAGAATAGACCTTGAGGATTGCTCCTTTCAGCAGTCTTTCAGAGATTCCTTCTTCTGTGTTGGATTACAAATTGCTTGTTCTGCTTTTGATTCTCTTTCAGCTTCTTTGCGGCAGCCACATCATGAAAGATCAACGTTTGAATTGTTTTGGGGAATGCATGAAGAACAATTCCAAGTTGTGCTTCTAGAGAAAATTCTTTTGCAGGTATACAAGATTGCCACTCATCTTCATGTGGATGTTGCTAATATGTGCTTACTTCAGGCCTTTAAAATGGTGAAAACTCATGGAGTTGTAATGAAGTCAAGTCTTACTTTTGTTATGGCTATATCAAGACTTATGTCATATGTTCCCGTAGACATGATTTCTTATTGTATGTTCCAAGTTACTAAGAGAAAAGCTGAAGTGCTGTTCCTTGTAGCCGGAACAAGCCCGATACATCTTTCAATATTCGGCCAACTTTTATCAGGCATGTTTGAAAAACAGGCTCACCTGAAGACCAATGCAACAAGAGGAACTTCTAATCCTTCTGATCTTGAGTTGTTGATGCTTCTTCCCACAGTATTCTTGTATTTAGATTCAGTTCTTAATAAAGCTGCGAGCAATGTAGATTATTTTGAGAATGTAGTTTCTTTCTACTGGCGGATGTTGTTGCATGGTTTCTCTAATTGGAAGTGCTATGTTTCCAGAGATATGTTCGACATGGAATGTTGCGACCAACCATGCTTATTGATGGAAGAATATATGGATATTTTCTCCAGCAGCCTGTTATCAAAATCTGTTCTTATGGTGCAACTTTGCTTTGCAGTAACCAAGGATTTGGTTAAATTTGAAAATAGGTTGGAACTATTTGACTCCGTTTGCCCTAAAAAAAGTACCTGTGTTGATTTTCTGGATTTTGATCCTAGTCAAGTTGGTCTTTGTTCACCTAAGCACTTGTTGAACTTTGTAAATAGGGCTGTTGCAAAGATACACCTTTGCAGAACACTGCTATTTCCTGATTATAACTTCTCCTCTTTGCTGAATGAATACAAAATGGAGACTCCTGCAAGTATTCAAGCAAAGGTGAACTCATCAAGAATCTTGTTTTTGAAGAGGTTAGTCTCTTCGTGGCGAAAAATGGTAATGAAAATCCCGAGGACTGCTAATGACTCCTGTCAAACAGATCTCGAAAAGTGTTCTGTGTTCAGATTTTTGGAAGTTCTTATTTTGAGAAATGTTGTGGAACTTTCTAAAGAGATGCACGATTGCCTTCTCAAGTTGGACTCTCTTCGGTTCATAGAGAAGTTTTCCGAGACAGCATTGTTGCATAGGTTTGATGATTCTACGACACTGCAGAAGCTTCGTTACATCATATCTTTGCTATTTGAAGGAAAGTTCTCATGTGATTCAATAATAAAATTGATTGTTCATGACTCCCGATTTGAACAAGCCATTTGTTCTTTAAATTTGTCAACTGAAAATTCCCAGCTTGGTCTCACATTTACTCCATTGCCAAGCCTTATGAAATCTGTTGTCACCCCTTCCATTGATAGGAAAGACAACCTGCAAGTGTTTAAGCAACATCCACACCTGTTGGAACTTATTAAATTGCTTAGGGTATTATTCCAGGTCTTGTCCCGACAGGTAGATCATGAATCAGCAAAAGGCGTCGGTATAAATTTAAGAGATTTGGTGTTTTTGTTACTATCTTGTTACAATGCAACTCTTTGTGAGGTTGACATTGAGATTTACAACCTATTGAATGAAATCATGTCAGTTAGTGACAGTTGTGCTCAAGGTATTGCTGAATGGGATTATCTCTGGGGCAATGCAGCTGTGCTAGTCAAGAAAGAGAGAGAACTAGCACAATCTGTTTCATGCAATGTAGGTGATGCTGAAGAGACTGTGGAATGGTGCAAAATTCAGTTTAGGAAAAACCTACCTATTGATCCCAAGATGTGTGCACATACTGTGCTTTATTTTCCATATTGGAGAAAAAGTAGTTCAGGAATTGTGAACAATGCTCAAAAGGATTTTTCTGATTGTTCAAATCAGGATTATTCTGCAGAAGTTAATAACAGATGTATATATGATCCCATCTTCATCTTACGATTCTCATTCCACTGTCTTTCAATGAGCTATATCGAACCTGTTGAGTTCGCTAATTTAGGCCTTCTTGCCGTCTCACTTGCGAGTATATCTTCTCCCGATGATGATATAAGGAAACTAGGATATGCAGTTCTTGAAAAATTCAAGGAGGTTTTAGAGAAATGTCAGAAGAGGAAGGATTTGATGGGTCTGCAACTCCTACTGTCGTATTTGCAGAATGGTATAGAAGAAGATTGGCAGAAAATTTCCTCTGTAACTGCCATATTCATTGCAGAGGCCTCACTTGTTCTTTTGAATCGTTCCCATGATCGTTATTCAGCTATAACTAAGCACCTAACACGGTCTCCCAGTATGAGTTTCAAGGGTGTACCATTGTTCCAGGATTCGTTCTGGAGTAATTCCGTCAGTTTCAGAACAGACAGGTTGTGGATACTTCATTTATTGTACTCAGGGTTGAACACAGAGGGTGATGTTCATATATACATCAGAAACTCCATTTTTGAGACCCTTCTAAGTTTCTATGTATCTCCTCTTGCTGATAATGAATCAAAAGAACTGATTATTCAGATCGTCAAGAAGTCTACCAAACTGCCTAAAATGGTGCGGCACTTAATTGAACATTGTGGTTTGGTCTCATGGCTTTCCTCAGTTGTCACAGCCTTCTGCGGAATTAAATACAATGAGTGGAAAGGCTTTCAGTTAACACATTTGGCTTTTGTCCTGGAGGTGGTCCATGAAATCCTCTTCTTCAGACACACTTTTGAGTGGCTACAAAAATATGCACTTGAACAGCTCTCTGAACTCTCTTGCCATTTGTCCCAAATCCTAGTTGAACGTGCGGATGTGTTGAAAGAACAGAACACTCTTACCATGTTGATTCTACAGATATTAACTTTGACATGGAAGATATCACAGAAGAGAAAAGTCTTTCAACCGCATTTCACTCTCTCTGTTGAGAGCTTATTTCACTTTTGTGAAGCCATTGATGTATGCTGCAACGGATGCTATAGCCCTATTGCGAAGATTGGGCTTGAAGCTGTACTTATGAGCACTCCTCCAGTAGGAATTATACATGTGGACCATGAAAAGGTTTTGAAATTCCTTAACTGGGCCATATCAATTGCTGTGCAGTCGGAGACAAGTGGAACACGTCATGTTCAAGATGGTTGTTGTAATCTGAATGTGTTCTCCGAGGAAGAGGGAGAAAGTTCTCTCGTATCAAAGCTTTTACGGTGGCTGACTGCTTCGGCGATCCTTGGGAAAATTTCATACAACTTAAAGAGATTTTATTCTCTTGACAGATCAAAACTTGTCAATTTGCAATGTTTATTGGCGTGGGACGAGGAAAGATATTTTGATAGCAATAAGGAGTTTGCATGCCAAGAGAGCATCTTAGCAATGTCAATCTTTTATTTGCAACAGTTACTGGGCACAAACTATAAATTGCTTCCATCTGTTGTTTCCGGGCTTCTTCTTCTTCATCATCATCATTTATCTTCTGCAGGATCAGACGCGTTGGTTGGCAATGCAGCTCATGTGTCAGAACTCTGCAAGAAAGTTCGTTGCCCCGTCGAAGCCAATTCTTCCTGGAGATGGGCATTTTACCAACCGTGGAAAGATCATTCCTCCAATCTCAGTGATTCCGAAAAAGTTGAAGAAATGCATGCTTGTCAGCTGCTTCTACTTTTTGTCTCCAAGATGCTCGGAGGAAATTCATTATTTTCTGGAGTTTTTTCAATTAAAGAGGTGGAGAAGTTGGGTGTGTTTGAATGGGAAAGGAGTATTCTAACTCTCAAAGAGTAA
Protein:  
MEDADNKNCGGVSVSHNFEGKVSMEAKLKQLLRNITSVENQLCFEASKEFIKLLKSESGSELIRLYLENSPKCIELSQTWDSQKGNPGFSYVLNLIAAVLSHPFGRSENNMQLLDKFARWVVDEKMDDLYKELNSKDVKSQNSTLSLLSAIVRRGSWLAGKVAKVFDFNLPLFRKPAKWKPRKGDVNRKHPSTRKAFVEFAMSFLEVGNARLLREVLQQKDLYLGVLRGLGKDEDDTVILVLSVLRDRVLVPESLVPPGLRSVLFGTVTLEQLVNISGRDDGGEAVELAHSVLLMVCTDPLNGLIPDLERIPSPLRGNPRRLLDVMKKLRATETEYHRNLLLAIVKAKPSLGSAYLDAFPYNTEDPASPNWFGTTLLAADLIFSVHDGYSFGFIDIMKQEPKSIECPELRSILKCICPCPFTRLIINKGLLHSDTLVKHGTLKLVLESLRFFDSLIDAVNCIPSSDIQMAPICSSLKLDIVNEVRILLPDPQVLFSLLSSLNDYHRIMESHGKRAADSEIPIEDNTSSRKKLKIDKSLKEDIDIIVGGISSFLSDTDMQGYGEGILDDDDSVQCKNESQNLKLIRELWSENSCSCKDTVEDAETIFYTKLLDVLKLYYRTMPNMMEGSFDFFKLLPSNPLALPIILQHSLLSLLTEDIGWSSTSETASRAQTQFYKHLLPLLNLLIYSPERSIKDHAYALAKAAMLSTGAFDNNPREVCAWFMFIPGYGEGYALAGDLKLEIFRKLSSGVLSFLCDAVSTVGNNMFKYMDLLRSYIHKSEDGKDVSATFSCFSICIMEKCLRILCSKPSSFSLSEKSMISFYVCNAFKYIMQTQVDPRLLASLTGRLLSERLTESYDIAADSNSFCEWTPLKKLFQFLRGILQGLTCNSFSSIVEIGHHDSAFKSILREVRSVCEMESDGRLVATGIGFSFSMICTQQADLLKNFPLTISLSNKMLEVPFSILMLIFFLEPNLLVNVSKLWPEMFLTGLEGAIAGLQRHEEPEEFGNIDSMEFASASFSLFLKHAPFYMLFPFIPSIYRFDLSAQGGLQNLILATLSERTPDYIISSFLYVLLWLNEAHRSYRIEPQDELEKLSEWCFSIMDHMLRRLVNTKVDSSLKCTRSILELVPTIISHPTVTAALECPIPSNAVLTDIYIGDSMDKFVESNKWKVIHKMDLHAINFLRTTSELFMYFCCGQRSSFVAFHARHVTHSFKNMVQKLFLTFRDSINKCIEDKDLAVLFPKVYALHSLRQFISPFDLLECVNWMLSRIDLEDCSFQQSFRDSFFCVGLQIACSAFDSLSASLRQPHHERSTFELFWGMHEEQFQVVLLEKILLQVYKIATHLHVDVANMCLLQAFKMVKTHGVVMKSSLTFVMAISRLMSYVPVDMISYCMFQVTKRKAEVLFLVAGTSPIHLSIFGQLLSGMFEKQAHLKTNATRGTSNPSDLELLMLLPTVFLYLDSVLNKAASNVDYFENVVSFYWRMLLHGFSNWKCYVSRDMFDMECCDQPCLLMEEYMDIFSSSLLSKSVLMVQLCFAVTKDLVKFENRLELFDSVCPKKSTCVDFLDFDPSQVGLCSPKHLLNFVNRAVAKIHLCRTLLFPDYNFSSLLNEYKMETPASIQAKVNSSRILFLKRLVSSWRKMVMKIPRTANDSCQTDLEKCSVFRFLEVLILRNVVELSKEMHDCLLKLDSLRFIEKFSETALLHRFDDSTTLQKLRYIISLLFEGKFSCDSIIKLIVHDSRFEQAICSLNLSTENSQLGLTFTPLPSLMKSVVTPSIDRKDNLQVFKQHPHLLELIKLLRVLFQVLSRQVDHESAKGVGINLRDLVFLLLSCYNATLCEVDIEIYNLLNEIMSVSDSCAQGIAEWDYLWGNAAVLVKKERELAQSVSCNVGDAEETVEWCKIQFRKNLPIDPKMCAHTVLYFPYWRKSSSGIVNNAQKDFSDCSNQDYSAEVNNRCIYDPIFILRFSFHCLSMSYIEPVEFANLGLLAVSLASISSPDDDIRKLGYAVLEKFKEVLEKCQKRKDLMGLQLLLSYLQNGIEEDWQKISSVTAIFIAEASLVLLNRSHDRYSAITKHLTRSPSMSFKGVPLFQDSFWSNSVSFRTDRLWILHLLYSGLNTEGDVHIYIRNSIFETLLSFYVSPLADNESKELIIQIVKKSTKLPKMVRHLIEHCGLVSWLSSVVTAFCGIKYNEWKGFQLTHLAFVLEVVHEILFFRHTFEWLQKYALEQLSELSCHLSQILVERADVLKEQNTLTMLILQILTLTWKISQKRKVFQPHFTLSVESLFHFCEAIDVCCNGCYSPIAKIGLEAVLMSTPPVGIIHVDHEKVLKFLNWAISIAVQSETSGTRHVQDGCCNLNVFSEEEGESSLVSKLLRWLTASAILGKISYNLKRFYSLDRSKLVNLQCLLAWDEERYFDSNKEFACQESILAMSIFYLQQLLGTNYKLLPSVVSGLLLLHHHHLSSAGSDALVGNAAHVSELCKKVRCPVEANSSWRWAFYQPWKDHSSNLSDSEKVEEMHACQLLLLFVSKMLGGNSLFSGVFSIKEVEKLGVFEWERSILTLKE